除了保护实验样品的安全性之外，实验室纯化项目也是保护实验成功和实验人员安全的主要手段之一。实验室净化项目是开放实验室的特定区域，专门用于建造具有洁净空气和高实验室环境要求的实验室或无菌室。实验室净化工程系统实际上与传统的洁净室系统相似，除了实验室洁净室中的压力，微生物控制，温度和湿度控制相对比工业洁净室更为严格。实验室净化项目中常用的装饰材料包括彩色钢板，钢化玻璃和耐火板。干净的实验室应使用密封良好的无尘材料进行隔室和天花板的装饰，以符合“洁净室的结构和要求”。通过“通过标准”，干净的实验室通风系统通常使用模块化空调单元。供气系统和不同行业的洁净室项目之间的区别在于，并非所有实验室都可以配备回风系统。这应基于用户对实验室或实验的使用。视产品而定。与生物安全实验室一样，不能使用回风系统，或者必须建造整个洁净室排。

实验室净化工程的水平设计也很重要。典型无菌实验室的清洁度为10,000，典型实验室的布局设计范围非常广泛，从100,000到10,000。生物安全实验室，阳性对照实验室和微生物培养实验室必须根据100级静态无尘室标准进行设计和建造。